計畫目標： 水鼩為野生動物保育法第三級保育類的物種，但目前對於其分布狀況與族群大小所知仍極為有限，本研究之目標： 於台灣地區各溪流之上游，選取平緩多淺灘且具有豐富植被的溪段進行水鼩之調查與捕捉，並初步估計其族群大小。 以粒線體DNA片段作為分子標記，探討台灣地區各溪流，山脈間與溪流內上下游間水鼩族群之是否因地形或人工建物的阻隔產生遺傳分化現象。 研究成果： 全台30個調查點中12處有捕獲水鼩個體，3處有發現水鼩糞便但未捕獲個體，而未捕獲且未發現水鼩糞便地點共15處。微棲地環境因子比較後發現有捕獲水鼩之地點溪流寬度較小，有較高比例的淺瀨面積，以及溪流沿岸有較高比例的草本植物或灌木覆蓋而較少禾本科雜草。粒線體DNA分析則顯示目前台灣島內之水鼩樣本可明顯分為二大群，但此二群間並沒有地理分隔的現象。 對業務革新、創新之效益： 本研究案旨在進行台灣地區整體性的水鼩分布調查，並未針對缺少各地點族群的細節資料進行調查，未來建議專案針對水鼩捕獲數量較多之特定族群（例如烏來、武陵、雪山坑、拉拉溪、眉溪地區）進行族群動態的長期調查，研究其族群密度變化，性別組成，活動與領域範圍等資料，作為保育決策之參考。
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