為保護野生動物及其棲息環境，我國自民國78年頒佈野生動物保育法後，即積極推動各項有關野生動物保育工作及野生動物保護區域之設立，並自80年起，依野生動物保育法規定，由農業部公告劃設野生動物重要棲息環境，再由地方政府就野生動物重要棲息環境有特別保護必要者，劃定為野生動物保護區，迄今共劃設了21處；其中玉里野生動物保護區及翡翠水庫食蛇龜野生動物保護區等2處，為農業部依據野生動物保育法第10條第3項規定，經野生動物保育諮詢委員會之認可後，逕行劃定為野生動物保護區。 107年4月28日起海洋委員會及所屬機關（構）正式成立，承接辦理海洋保育事務，爰桃園觀新藻礁生態系野生動物重要棲息環境、馬祖列島燕鷗保護區、棉花嶼、花瓶嶼野生動物保護區、澎湖縣望安島綠蠵龜產卵棲地保護區及澎湖縣貓嶼海鳥保護區等5處野生動物保護區之中央主管機關業務已移交其承接辦理。 陸域野生動物保護區圖資請至農業資料開放平臺下載。
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